按照新政策的调整，乡镇指定医院，农民花销100元以上的报销比例可达到85%，县级医院按照400元以上可报销，比例达到75%，市级医院需达到1000元以上才可报销，报销比例为65%。
1、门诊报销比例：如果是在村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%；镇卫生院就诊报销40%；二级医院就诊报销30%；三级医院就诊报销20%。
2、住院报销比例：镇卫生院报销60%；二级医院报销40%；三级医院报销30%。
3、大病医疗报销比例：凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。并且只要是在镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗，每年还可限额补偿1.1万元。
对于新型农村合作医大病报销，其报销比例根据不同医院等级，其报销比例会有所不同。除了发生超过基本医疗统筹基金最高支付限额以上的医疗费用，按照不同范围的医疗费用，其报销比例会有所不同。
一般医疗费用花费在0—4万元以下的可以报销85%；医疗费用在4万—8万元以下的可以报销90%；医疗费用在8万元以上的可以报销95%，并且在每一个医疗年度内，最高支付的限额为15万元。
门诊统筹乡、村补助比例分别提高到了65%、75%。新型农村合作医疗大病保险的报销，根据在不同等级医院，其报销比例会有所不同。
新农合住院报销比例